西藏大学医学院的前身是创建于1972年的西藏自治区卫校，历经西藏医学院（1977年）、西藏自治区综合卫生学校（1982年）和西藏大学医学专科学校（1996年）四个发展阶段。2001年，西藏自治区人民政府决定将原西藏大学医学专科学校和西藏民族学院原医学系并入西藏大学，组建了西藏大学医学院。2020年6 月，西藏自治区人民政府划拨自治区第二人民医院作为西藏大学第一附属医院。  

目前，学院现有教职工104人，全日制学生1400余人。拥有1个博士学位授予点、3个二级学科硕士点、2个一级学位硕士点和2个专业硕士学位点；设有临床医学、口腔医学、预防医学、药学、护理学5个本科专业；拥有1所直属附属医院、1所教学医院、6所非直属医院；配置有20多个先进、管理规范的实验室及价值达8000余万元的教学科研设备；拥有一个自治区重点实验室（西藏大学高原健康科学研究中心），两个厅（局）级重点实验室（高原医学研究（实验）中心、藏药现代化研发与藏药质量检测实验中心）；拥有两个省级实验教学示范中心（临床技能实验教学示范中心、机能学实验室）。

学院于2015年3月荣获中华全国妇女联合会“巾帼文明岗”荣誉称号；2016年3月荣获西藏自治区教育厅、自治区妇女联合会“教育行业妇女岗位建功先进集体”荣誉称号；2019年获得“西藏自治区教育先进单位”“西藏自治区强基惠民驻村工作先进单位”荣誉称号； 2021年临床医学专业获批为自治区级一流本科专业，2022年预防医学专业获批为国家级一流本科专业建设点。

医学院教职工第一党支部获批全国高校“双带头人”教师党支部书记工作室；医学院教职工第一党支部获得第17届“西藏青年五四奖章集体”荣誉称号；医学院教职工第二党支部获批全区民族团结进步基层党组织示范点。

学院在“十四五”期间以“习近平总书记给西藏大学医学院在首钢医院实习学生的重要回信”精神为指引，不断为建设成西藏自治区现代医学专门人才的培养中心，藏药现代化研究与开发基地以及高原医学研究和西藏地方病、多发病研究基地的长远目标坚持奋进。